小工厂最怕的部门主要包括：
环保部门：
因为环保法规日益严格，一旦违规排放或不符合环保标准，将面临罚款甚至停产整顿的风险。
劳动局：
负责监管工厂的劳动法规遵守情况，如是否存在雇佣童工、拖欠工资等违法行为，违规企业可能面临法律制裁。
质量部门：
产品质量直接关系到企业的销量和信誉，一旦出现质量问题，可能导致销量下降，社会信誉受损，甚至影响工厂的生存。
消费者投诉热线（如12315）：消费者对产品或服务不满意可以拨打此电话进行投诉，影响企业声誉和客户满意度。
劳动保障监察部门（如12333）：如果企业涉嫌侵犯员工权益，员工可以拨打此电话进行投诉举报，可能导致劳动纠纷和法律诉讼。
这些部门都可能给工厂带来严重的后果，包括法律处罚、声誉损害和经济损失。因此，工厂需要严格遵守相关法律法规，并做好内部管理和监督来避免这些问题