办理父女关系证明，可以选择以下几种方式：
户籍所在地的派出所
如果户口在同一户口本上，可以直接到父亲户籍所在地的派出所开具证明。派出所会有档案可以直接调取，并且会出具盖有公章的证明材料。
调取人事档案
如果户口不在同一个户口本上，可以尝试调取人事档案，在人事档案中一般会有父女关系的相应证明。查询情况属实后，工作人员会开具证明并盖章。
出生地的疾病控制中心
另一个选择是到出生地的疾病控制中心，请求工作人员帮助开具父女关系证明。需要提供相应的材料以证明两人确实是父女关系。
村委会或社区
在一些情况下，可以先去老家的村委会或社区写个证明，再到当地派出所办理。如果有出生证明，则直接携带出生证明去派出所。
公证处
如果需要将父女关系证明用于公证，可以到公证处提出公证申请，并提交相关证明材料，如身份证、户口本等。公证员会进行询问并制作公证书。
建议
准备材料：在前往办理之前，务必准备好所有必要的材料，如身份证、户口本、出生证明等。
咨询当地派出所：由于不同地区的具体办理流程和所需材料可能有所不同，建议提前咨询当地派出所或公安局的具体要求，以确保流程顺利进行。
全程网办：目前一些地方已经实现了亲属关系证明的全程网办，可以通过“警快办”等线上平台进行申请，这样可以节省时间和精力。