土地纠纷应该根据具体情况选择合适的部门进行处理：
村委会
村委会是调解土地纠纷的首选机构，熟悉本地地界和人员关系，能够通过协商解决问题。调解结果具有非强制性，如果调解无效，可以考虑更高一级的部门介入。
乡镇政府
如果村委会的调解无法解决问题，可以向乡镇政府寻求帮助。乡镇政府具有更高的行政权力，能够召集双方进行深入调解，甚至作出行政指导性意见。对于承包土地的合同纠纷，乡镇政府可以结合承包法和地方政策提供更具体的解决方案。
土地管理部门
如果问题涉及土地权属归属，可以向土地管理部门反映。土地管理部门负责土地权属争议的调查和认定工作，能够出具权威认定文件。在农村土地流转过程中，这类纠纷较为常见。如果土地管理部门无法直接解决问题，它们也会提供明确的法律建议或指引后续流程。
法院
当调解和行政手段无效时，诉诸法律是最可靠的方式。法院是最终解决土地纠纷的法律途径，当事人可以向法院提起诉讼。
建议
先尝试调解：纠纷发生时，首先应尝试通过村委会或乡镇政府进行调解，因为这些机构更熟悉本地情况，调解结果也具有法律效力。
逐级升级：如果调解无效，可以逐步升级到乡镇政府或土地管理部门，寻求更高层次的帮助和解决方案。
法律途径：当其他途径都无法解决问题时，最终可以选择向法院提起诉讼，通过法律手段解决土地纠纷。