单位扣押护照的原因主要有以下几点：
限制出境
公务员和行政事业单位工作人员：这些人员因工作需要被限制出境，如果需要因私出境，必须提前向组织申请并获得批准。
敏感行业或保密单位员工：即使因私出国，这些员工也需要得到单位的指示和批准，用完因私护照后单位要收回。
单位管理需要
经常出差或境外业务：一些事业单位的工作性质需要员工频繁出差或前往境外进行业务活动，因此要求员工将护照和通行证交由单位统一管理，以便于组织出差和境外活动。
防止逃避责任或逃离国内：集中保管护照可以防止员工在离开后逃避合同约定的责任或逃离国内。
法律和安全规定
国际劳工组织规定：扣押护照严重违反国际劳工组织规定，限制公民人身自由。
《中华人民共和国护照法》：根据该法律，任何组织或个人不得非法扣押护照，除非是人民法院、人民检察院、公安机关、国家安全机关、行政监察机关因办理案件需要。
建议
员工应提前申请：如果员工需要因私出境，应提前向组织申请并获得批准，以遵守相关规定。
单位应合理管理：单位应制定明确的管理规定，确保员工护照的合理使用和保管，同时尊重员工的人身自由和隐私权。
遵守法律法规：任何单位和个人在处理护照时，都应严格遵守《中华人民共和国护照法》等相关法律法规，避免违法行为。