公司申请商标注册的流程如下：
确定商标使用项目
确定商标将用于哪些产品或服务。
根据产品或服务确定要注册的商标类别。
商标查询
在申请前进行商标查询，以确认商标是否已被他人注册或正在申请中。
可以通过商标局官方网站或专业代理机构进行查询。
商标风险评估
评估商标的注册风险，确保没有违反商标法规定。
若存在风险，需重新设计商标或调整申请策略。
准备申请材料
准备公司营业执照副本复印件、商标图样等必要文件。
若申请人为个人，则需提供个人身份证复印件及个体工商户营业执照。
提交商标注册申请
登录国家商标局网站，按照提示填写商标注册申请资料。
确认无误后，通过网银转账缴纳申请费用。
等待受理与审查
提交申请后，商标局进行形式审查，通常需要20天左右。
形式审查通过后，会收到商标受理通知书。
实质审查通常需要6个月左右，通过后会进入商标初步审定公告。
公告与发证
初步审定公告之日起三个月内，若无异议，则进入核准公告期。
核准公告期满后，商标局颁发商标注册证书。
建议
选择代理机构：若公司缺乏专业的知识产权团队，建议委托专业的商标代理机构进行申请，以确保流程顺利进行并提高注册成功率。
详细准备资料：确保所有申请材料的真实性和完整性，避免因资料问题导致申请被驳回。
及时响应：在申请过程中，保持与商标局的沟通，及时处理任何补正或异议，确保申请进度。